Ferry de Jong promoveerde in september 2009 cum laude op het proefschrift Daad-Schuld. Bijdrage aan een strafrechtelijke handelingsleer met bijzondere aandacht voor de normativering van het delictsbestanddeel opzet (Pompe reeks, deel 60). In het boek wordt een (rechts)filosofisch gezichtspunt ingenomen, van waaruit de strafrechtelijke concepten gedraging, opzet en schuld worden geanalyseerd in relatie tot corresponderende vóór-juridische concepten.
Zijn huidige onderzoeksbelangstelling gaat uit naar de achtergronden en functie(s) van en ontwikkelingen binnen de strafrechtsdogmatiek als zodanig, naar de concepten gezag en legitimiteit in relatie tot de strafrechtspleging, naar de betekenis van de noties (wils)vrijheid en verantwoordelijkheid binnen het strafrecht, alsmede naar de toepassing van rechtstheoretische en filosofische inzichten op verscheidene strafrechtelijke onderwerpen.