Daan Scheepers promoveerde in de sociale psychologie aan de Universiteit van Amsterdam in 2002 (titel proefschrift: The social functions on in-group bias). Tussen 2004 en 2007 werkte hij als postdoc op een VENI subsidie van de Nederlandse organisatie van Wetenschappelijk Onderzoek (NWO), en vervolgens als universitair docent (2007-2013) en universitair hoofddocent (2013-nu) sociale, economische, en organisatiepsychologie aan de Universiteit Leiden. Sinds 2018 werkt Daan ook als (deeltijd) hoogleraar psychofysiologie van groepen aan de Universiteit Utrecht. 

Daan was onderwijsdirecteur van het Kurt Lewin Institute (landelijke onderzoeksschool sociale psychologie) en Associate Editor van het Journal of Personality and Social Psychology.