Wieger Bakker studeerde sociologie van planning en beleid aan de Rijksuniversiteit Utrecht. Hij studeerde af op een onderzoek naar theorie en praktijk van beleidsinstrumenten en schreef later een proefschrift over de invloed van overheidsbeleid op de ontwikkeling van een deel van het (beroeps)onderwijs. Vanaf 1984 was hij binnen de Faculteit Sociale Wetenschappen achtereenvolgens verbonden aan de opleidingen Sociologie en Algemene Sociale Wetenschappen en aan het interfacultaire Centrum voor Beleid & Management. In 1998 werd hij universitair docent bij de Faculteit Rechtsgeleerdheid voor de juridisch bestuurskundige opleiding RBM (Recht, Bestuur en Management). Sinds 2000 is hij werkzaam bij het Departement Bestuurs- en Organisatiewetenschap voor de gelijknamige opleiding (B&O), vanaf 2002 als hoofddocent Bestuur en Beleid en met ingang van 1-7-2015 als hoogleraar Maatschappijgericht Hoger Onderwijs.