Boer studeerde rechten - LLB Rechtsgeleerdheid; LLM Staats- en bestuursrecht (cum laude) - en filosofie (BA) aan de Universiteit Utrecht. Tijdens zijn studie was hij onder meer werkzaam als stagiair bij de rechtbank Midden-Nederland en als student-medewerker bij het advocatenkantoor Pels Rijcken & Droogleever Fortuijn. Ook was hij als student-assisent aan de Universiteit Utrecht verbonden en was hij voorzitter van de Rechtswinkel Utrecht. Alvorens hij begon aan zijn promotietraject was Boer werkzaam als Junior Docent en verzorgde hij werkgroeponderwijs voor de vakken Grondslagen van Recht, Bestuursrecht en Constitutioneel Recht.