This is a list of literature reports and research projects of bachelor and master students that I have supervised in recent years. It can serve to guide students looking for a supervisor.
Year | Supervisor | Division | Referee | Title |
2024 | Roland Pieters | CBDD | Ed Moret | Computer Based Drug Design and Machine Learning for the Computational Search of Novel Carbohydrate Binding Protein Inhibitors |
2024 | Alexander Yermanos | CTI | Ed Moret | Decoding in vivo B cell selection with protein language models |
2024 | Can Kesmir | TB&B | Ed Moret | Exploring TCR sequences: what information does it hold on its specificity? |
2024 | Ed Moret | CBDD | Jet van der Zijden | The role of gene therapy in Amyotrophic Lateral sclerosis: current insights and prospects |
2024 | Ed Moret | CBDD | Liesbeth Bijlsma | Werkingsmechanisme van methylfenidaat en amfetaminezouten bij ADHD |
2024 | Ed Moret | CBDD | Erik Hendriksen | Farmacodynamie van spanningsafhankelijke natriumkanaal aangrijpende middelen |
2023 | Nishant Sewgobind | CBDD | Ed Moret | Virtual screening for non-carbohydrate inhibitors for cholera toxin B |
2023 | Chimed Jansen | Acerta | Ed Moret | Machine learning enhanced virtual screen of undisclosed tyrosine kinase mutant for restoring WT activity |
2023 | Liesbeth Bijlsma | PCOL | Ed Moret | De kynurenine pathway als potentieel aangrijpingspunt voor de behandeling van neurodegeneratieve aandoeningen: pathologische en therapeutische implicaties |
2023 | Ed Moret | CBDD | Roland Pieters | An overview of scoring functions for proton-ligand interactions in molecular docking - limitations and possible improvements |
2023 | Balthasar Heesters | CBDD | Ed Moret | Transport of immune complexes in the germinal centre: An in vitro Assay |
2022 | Alexandre Bonvin | CSB | Ed Moret | Recent developments in the consideration of entropy in drug design via Molecular Dynamics simulations |
2022 | Ed Moret | CBDD | Maarten Altelaar | Anti-cancer mechanisms of the most used drugs worldwide: old drugs, new insights |
2022 | Ed Moret | CBDD | Alexandre Bonvin | Machine learning methods used during the D3R protein-ligand docking Grand Challenges |
2022 | Ed Moret | CBDD | Balthasar Heesters | Verbeteren van de passage van antilichamen door de bloed-hersenbarriere |
2022 | Ed Moret | CBDD | Dirk Rijkers | Virtual screening in multi-target drug design |
2021 | Ed Moret | CBDD | Nishant Sewgobind | A virtual screening study of existing drugs against the S1 unit of the SARS-CoV-2 spike protein to identify potential candidates for the treatment/prevention of COVID-19 |
2021 | Ed Moret | CBDD | Wei Wu | The role of Human Leukocyte Antigen in Predicting SARS-CoV-2 Disease Severity |
2021 | Hugo van Ingen | NMR | Ed Moret | K6-linked di-Ubiquitin: molecular basis of specific recognition by UBXN1 and UBAC2 UBA domains |
2021 | Laura Heitman | LACDR | Ed Moret | Receptor Ligands as Substrates for Transporters: Modulating Receptor Activity through Ligand Availability |
2021 | Ed Moret | CBDD | Enrico Mastrobattista | De potentie van celtherapie bij de ziekte van Alzheimer |
2021 | Alexandre Bonvin | CSB | Ed Moret | Current modelling approaches to generate 3D structures of protein-oligosaccharide complexes |
2020 | Alexandre Bonvin | CSB | Ed Moret | Protein pocket detection to guide shape-based protein-ligand docking in HADDOCK |
2020 | Ed Moret | CBDD | Alexandre Bonvin | The Search for Parameters for False Positive Prediction in Molecular Docking |
2020 | Ed Moret | CBDD | Bas van Breukelen | De effecten van stamceltherapie en groeifactortherapie op ALS |
2020 | Ed Moret | CBDD | Dirk Rijkers | In silico docking for drug repurposing against COVID19 |
2020 | Jan Riezebos | PECP | Ed Moret | Gentherapie bij de behandeling van hemofilie |
2020 | Jet van der Zijden | PECP | Ed Moret | Deep brain stimulation: laatste redmiddel of nieuwe standaard? |
2020 | Ed Moret | CBDD | Liesbeth Bijlsma | Niet-motorische symptomen bij de ziekte van Parkinson |
2020 | Ed Moret | CBDD | Liesbeth Bijlsma | De rol van de bloed-hersenbarriere bij de ziekte van Alzheimer en de consequentie voor therapie |
2020 | Ed Moret | CBDD | Aletta Kraneveld | De rol van het microbioom bij de ziekte van Parkinson |
2019 | Ed Moret | CBDD | Liesbeth Bijlsma | CYP450 enzymen in de hersenen betrokken bij de ziekte van Parkinson |
2019 | Ed Moret | CBDD | Roos Masereeuw | Het gebruik van organoiden voor regeneratieve geneeskunde |
2019 | Ed Moret | CBDD | Frank Redegeld | Wat zijn de mogelijke aangrijpingspunten ter behandeling van Multiple Sclerosis (MS) |
2019 | Ed Moret | CBDD | Liesbeth Bijlsma | Serotonerge en noradrenerge neuronen in de ziekte van Parkinson |
2019 | Ed Moret | CBDD | Aletta Kraneveld | De rol van Braak stagering in de pathologie van de Ziekte van Parkinson |
2019 | Jet van der Zijden | PECP | Ed Moret | Het effect van de remming van eiwitsynthese van huntingtine met gen-silencingtechnieken op de ziekte van Huntington |
2019 | Geert-Jan Boons | CBDD | Ed Moret | Veranderingen en functies van glycaanexpressie bij kanker, en het gebruik hiervan om huidige biomarkers voor de diagnose van kanker te verbeteren |
2019 | Liesbeth Bijlsma | PCOL | Ed Moret | Vergelijking fenobarbital en levetiracetam bij neonatale convulsies bij hypoxisch ischemische encefalopathie |