Wieger Bakker is emeritus hoogleraar Maatschappijgericht Hoger Onderwijs van de faculteit Recht, Economie, Bestuur en Organisatie (REBO) en daarbinnen van de Utrechtse School voor Bestuurs- en Organisatiewetenschap. Van 2017 tot 2023 was hij voorzitter van het bestuur van het Centre for Academic Teaching and Learning van de Universiteit Utrecht (zie https://www.uu.nl/onderwijs/centre-for-academic-teaching-and-learning). Eerder was hij onderwijsdirecteur van de bacheloropleiding Bestuurs- en Organisatiewetenschap en coördinator van de double degree masteropleiding European Governance.

Van december 2018 tot en met december 2025 was hij Dean Lifelong Learning voor de Universiteit Utrecht (zie https://professionals.uu.nl/ en https://intranet.uu.nl/onderwijs-voor-professionals).

Sinds 2020 is hij bijzonder hoogleraar Governance, Community and Cohesion aan de Faculty of Arts and Sciences van de Universiteit van Aruba (www.ua.aw). In 2022 werd hij voor een tweede termijn gekozen als adjunct-directeur van het Inter University Centre Dubrovnik, Kroatië (www.iuc.hr).