Verkuyten is opgeleid als sociaal psycholoog en antropoloog. Hij promoveerde aan de Erasmus Universiteit Rotterdam (1988) en werkte daar als universitair docent aan de Faculteit der Rechtsgeleerdheid. In 1993 verhuisde hij naar de Universiteit Utrecht  om daar eerst als universitair hoofddocent en later als hoogleraar bij de faculteit Sociale Wetenschappen aan de slag te gaan.