Mark Bovens is als hoogleraar Bestuurskunde verbonden aan het departement Bestuurs- en Organisatiewetenschap (USBO) van de Universiteit Utrecht. Daarnaast is hij lid van de Wetenschappelijke Raad voor het Regeringsbeleid (WRR) in Den Haag.

Centrale thema's in zijn onderzoek zijn onder andere: publieke verantwoording; klokkenluiden; politieke verantwoordelijkheid; diplomademocratie en opleiding als sociale en politieke scheidslijn; politiek vertrouwen; en succes en falen van beleid.