Koen Hoogendoorn is historicus en promoveert aan de Universiteit Utrecht binnen het NWO-Zwaartekrachtprogramma Adapt!. Hij doet lokaal historisch onderzoek in onder andere de Utrechtse wijk Zuilen en de Antwerpse wijk Borgerhout, en bevraagt of het delen van lokale geschiedenissen kan bijdragen aan veerkracht in tijden van crisis.
Naast zijn promotieonderzoek is hij verbonden aan de Wetenschappelijke Raad voor het Regeringsbeleid (WRR), waar hij werkt aan het adviestraject Synthetisch Drugsbeleid. Eerder droeg hij bij aan het rapport Aandacht voor Media (2024) en publiceerde hij een paper over mediawijsheid (2024).
Zijn meest recente publicatie is de historische achtergrondstudie 'Een tegenstrijdig evenwicht. Tussen economie, tolerantie en diplomatie in de Nederlandse omgang met drugs (1875-2025)' (WRR, 2026). Daarin laat hij zien hoe drie logica's (economisch-pragmatisch, cultureel-normatief en internationaal-diplomatiek) door anderhalve eeuw Nederlandse drugsgeschiedenis heen steeds opnieuw botsen en worden verzoend.