Prof. dr. Joop Schippers startte op 1 september 1978 als student-assistent bij de Universiteit Utrecht, waar hij in 1987 promoveerde en in 2000 benoemd werd als hoogleraar. In 2022 vierde hij zijn 40-jarig jubileum bij de UU. Op 1 januari 2025 ging hij met emeritaat. Ter gelegenheid daarvan sprak hij op 12 juni 2025 een afscheidsrede uit. Zijn onderzoek, dat hij ook na zijn emeritaat voortzet, richt zich op uiteenlopende aspecten van de arbeidsmarkt. De laatste jaren staan vooral zijn activiteiten als een van de coördinatoren van de hub/het platform Future of Work (https://www.uu.nl/fow/over-de-future-of-work/kernteam?msclkid=feaaac59bb1511ecbd104ef904e06f3f) centraal. Inhoudelijk richt hij zich onder andere op de steeds meer gevoelde krapte op de arbeidsmarkt, hybride werken en demografische verschijnselen als ontgroening en vergrijzing en de gevolgen daarvan voor de arbeidsmarktpositie van oudere en jongere werknemers. Daarnaast zet hij de lange onderzoekstraditie van de Universiteit Utrecht voort op het terrein van het onderzoek naar genderverschillen op de arbeidsmarkt, waarbij hij ook steeds expliciet aandacht besteedt aan de rol van instituties (formele en informele regels) voor het gedrag van individuen en organisaties. 

Zijn onderzoek kenmerkt zich door een multidisciplinaire benadering en een sterke (theoriegestuurde) empirische oriëntatie. Gedurende zijn gehele loopbaan in de wetenschap heeft hij vooral veel onderzoek verricht onder Nederlandse en Europese werkgevers (zowel surveyonderzoek als case studies). Behalve dat hij zelf een lange reeks nationale en internationale publicaties op zijn naam heeft staan, was en is hij ook betrokken bij een reeks promotieprojecten.

In 2019 was hij als NSvP-fellow verbonden aan het NIAS (Netherlands Institute for Advanced Study in the Humanities and Social Sciences).

Een groot deel van zijn onderzoek vindt plaats in het kader van multidisciplinaire, soms internationale, onder andere door de Europese Unie gefinancierde projecten. Van 2008 tot 2015 was hij actief als coördinator van het Europese project Activating Senior Potential in Ageing Europe (ASPA). Eerder was hij betrokken bij projecten als FENICs, WELLKNOW, TLM.net, QUALITY en Fair Play for Older Workers.

Joop Schippers was als docent de laatste jaren vooral betrokken bij de Master European Governance. Eerder gaf hij mede vorm aan interdisciplinaire vakken als Arbeidsvraagstukken, Aspecten van de Verzorgingsstaat, Beleidsatelier, Openbare Financiën en Economische en Juridische Aspecten van Collectieve Besluitvorming. 

Sinds 2022 is hij voor een halve dag per week als research fellow (in de rang van lector) verbonden aan de Hogeschool Rotterdam (Kenniscentrum Business Innovation) en eveneens als (honorair) affiliated research fellow aan het Nederlands Interdisciplinair Demografisch Instituut (NIDI) in Den Haag. 

Daarnaast was en is hij actief in bestuurlijke functies binnen en buiten de Universiteit Utrecht. Binnen de UU was hij onder andere vice-decaan en portefeuillehouder onderwijs van de toenmalige faculteit Rechtsgeleerdheid, directeur van het TKI-onderzoeksinstituut van het departement Economie en voorzitter van de vakgroep Fiscaal Recht. Van 2007-2023 is hij voor Lijst VLAM lid geweest van de Universiteitsraad van de Universiteit Utrecht, een groot deel van de tijd ook als voorzitter van de personeelsgeleding in de raad, en van 2019-2023 lid van het dagelijks bestuur van LOVUM (Landelijk Overleg Voorzitters Universitaire Medezeggenschapsorganen: https://www.lovum.net/?msclkid=0fd56e6abb1c11ecacd07ae3af62ef22). Eerder was hij voorzitter van de Faculteitsraad van de faculteit Recht, Economie, Bestuur en Organisatie, lid van de Wetenschapscommissie van het Nederlands Interdisciplinair Demografisch Instituut (Onderdeel van de KNAW) en de Raad van Toezicht van de Universiteit voor Humanistiek. Ook was hij lid van de (laatste) Emancipatieraad, TECENA en de Visitatiecommissie Emancipatie. Sinds begin 2013 maakt hij deel uit van de Monitorcommissie Talent naar de Top en van 2013-2020 was hij lid van de Monitorcommissie voor de Wet bestuur en toezicht. Sinds 2021 is hij lid van de Raad van Advies SER Topvrouwen en Diversiteitsportaal, die de monitortaken van de Monitorcommissie heeft overgenomen. Sinds 2020 is hij voorzitter van de door NRO (Nationaal Regieorgaan Onderwijsonderzoek) ingestelde Programmacommissie Project Onderwijs-Arbeidsmarkt (POA) dat zich bezighoudt met de jaarlijkse verkenningen van de positie van afstudeerders van verschillende opleidingen in Nederland. Tevens is hij vice-voorzitter van de door ZonMw ingestelde Programmacommissie voor het NWA-programma Economische veerkracht van vrouwen.  

In het kader van zijn disseminatie- en valorisatieactiviteiten is hij regelmatig terug te vinden in dag- en weekbladen. Hij is de geestelijk vader van de in 2019 gestarte podcastreeks van de hub Future of Work (Future of Work podcast - Future of Work - Universiteit Utrecht) die deel uitmaakt van het universitaire strategische speerpunt Instituties van de Open Samenleving. Van 2010 t/m 2013 was hij onderdeel van de vaste kern van het economenpanel 'Klinkende Munt' zoals dat wekelijks werd uitgezonden in het programma Villa VPRO op Radio1. Hij is tevens te volgen op X: http://X.com/JoopSchippers. Voor zijn bijdragen aan de valorisatie en disseminatie van wetenschappelijke kennis voor een breder publiek ontving hij begin 2013 de eerste PubliPrijs van de Universiteit Utrecht. In 2022 reikte de Universiteit Utrecht hem de Zilveren Erepenning uit, voorzien van de tekst "Joop Schippers - kritisch en loyaal met passie voor medezeggenschap en wetenschap".