23.01.2012 | Faculteit Bètawetenschappen
Scheikundestudenten rekenen met krachtige computerinfrastructuur aan hiv
Scheikundestudenten van de Universiteit Utrecht gebruiken de HPC Cloud-infrastructuur van SARA en BiG Grid om mutaties van hiv te simuleren. Dit is de eerste keer dat bachelorstudenten gebruik kunnen maken van deze Cloud-omgeving, waarbij een virtuele computer toegang geeft tot enorme rekenkracht en grootschalige dataopslag. De studenten hebben tot eind januari de mogelijkheid om op een realistische manier te experimenteren met de omvangrijke berekeningen van eiwitonderzoek.
De computerberekeningen zijn een onderdeel van het Utrechtse scheikundevak Molecular Modeling and Mathematics van prof. Alexandre Bonvin en vinden plaats op de door BiG Grid gefinancierde HPC Cloud-infrastructuur bij SARA. In de cursus proberen de studenten een huidige onderzoeksvraag te beantwoorden, namelijk hoe enkele mutaties in een eiwit van hiv het infectiegevaar van het virus kunnen beïnvloeden. Hele kleine veranderingen in een paar aminozuren van dit eiwit hebben al grote invloed op de infectie eigenschappen van dit virus.
Virtuele computer
Met deze infratructuur beschikken de studenten over krachtige faciliteiten waarmee zij binnen een paar weken een groot aantal mutaties in het virus tot op de moleculaire details kunnen simuleren. Op een gewone computer nemen dit soort berekeningen 100 keer zoveel tijd in beslag.
Ook scheikunde studeren?
Kijk voor meer informatie bij de bacheleloropleiding Scheikunde