Esther Nauta is als promovenda verbonden aan het Utrecht Centre for Accountability and Liability Law (UCALL) en het Willem Pompe Instituut voor Strafrechtswetenschappen. Haar onderzoek richt zich op de normering van vrijheidsbenemende maatregelen in het strafrecht vanuit rechtsvergelijkend en grondrechtelijk prespectief. Het onderzoek wordt begeleid door Gerben Meynen, Johannes Bijlsma, Ferry de Jong en Lydia Dalhuisen. 

Daarnaast is Nauta als junior onderzoeker verbonden aan het VICI-project Law and Ethics of Neurotechnology in Criminal Justice (LENC) geleid door prof. Gerben Meynen. 

Haar onderzoeksinteresses liggen op het gebied van rechtsvergelijkend onderzoek en grondrechten, en in de intersecties tussen verschillende rechtsgebieden.

Van februari tot mei 2022 was zij ten behoeve van haar promotieonderzoek gastonderzoeker aan het Max-Planck-Institut zur Erforschung von Kriminalität, Sicherheit und Recht in Freiburg im Breisgrau.